Ένα διαφορετικό πρωτάθλημα διεξήχθη την περίοδο 1979-80, μοναδικό στην ιστορία της διοργάνωσης. Οι ομάδες χωρίστηκαν σε δύο ομίλους, Βορρά και Νότου και οι τρεις πρώτες κάθε ομίλου αγωνίστηκαν για το πρωτάθλημα. Ο Παναθηναϊκός τερμάτισε πρώτος και αήττητος στο Νότο (16-0, 1572-1250) και βρέθηκε στην κορυφή και στο φινάλε του πρωταθλήματος με ρεκόρ 12-2 (1342-1135). Στην πέμπτη θέση των σκόρερ βρέθηκε ο Απόστολος Κόντος (634π.). Στη σύνθεση της ομάδας είχαν προστεθεί παίκτες όπως ο Ντέιβιντ Στεργάκος και ο Κυριάκος Βίδας.

Η σύνθεση της πρωταθλήτριας ομάδας: Κόντος, Κορωναίος, Βίδας, Στεργάκος, Κοκολάκης, Ιωάννου, Μπατής, Παπάζογλου, Παπαντωνίου, Γκάρος, Γεωργανάς, Καλογερόπουλος. Προπονητής: Κώστας Πολίτης