Η δεύτερη συνεχόμενη κατάκτηση του Κυπέλλου Ελλάδας για τον Παναθηναϊκό συνοδεύτηκε από τον τρίτο αποκλεισμό από τη διοργάνωση του Ολυμπιακού και μάλιστα εκτός έδρας με το «εκκωφαντικό» 51-81. Πριν την αναμέτρηση με τους «ερυθρόλευκους» οι «πράσινοι» είχαν αποκλείσει τον Ηρακλή, ενώ στη συνέχεια απέκλεισαν με διπλό ημιτελικό την ΑΕΚ. Στον τελικό, ο οποίος φιλοξενήθηκε στο κλειστό του Γαλατσίου, ο Παναθηναϊκός πήρε τη νίκη από το Μαρούσι, με τον Κώστα Τσαρτσαρή να αναδεικνύεται MVP της αναμέτρησης με 16 πόντους και δύο τρίποντα.

Τα αποτελέσματα

Β’ Φάση

8/10/2005

ΓΣ Ηρακλής-Παναθηναϊκός 72-87

Προημιτελικοί

12/10/2005

Ολυμπιακός-Παναθηναϊκός 51-81

Ημιτελικοί

16/10/2005

Παναθηναϊκός-ΑΕΚ 76-66

19/10/2005

ΑΕΚ-Παναθηναϊκός 73-78

Τελικός

18/3/2006

Παναθηναϊκός-ΓΣ Αμαρουσίου 68-57

Διαιτητές: Πιτσίλκας - Ζαβλανός – Παπαδημητρίου

Παναθηναϊκός (Ομπράντοβιτςς): Αλβέρτης, Παπανικόλαου, Σεπάνοβιτς 6 (2), Τσαρτσαρής 16 (2), Μπατίστ 10, Χατζηβρέττας 2, Φέμερλινγκ , Λάκοβιτς 13 (2), Σπανούλης 7, Διαμαντίδης 5, Τομάσεβιτς 9, Σάκοτα

Μαρούσι (Γιαννάκης): Μπλάκνει 22 (5), ΝικολαΪδης 3 (1), Μπουντούρης, Κυρίτσης 12, Σέκουλιτς 5 (1), Χόμαν 9, Στεφανίδης 3 (1), Κολώκας, Καϊμακόγλου 1, Καράγκουτης 2, Γιαννουλάκος, Νοέας